Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEP44Q9C0F1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP44Q9C0F1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP44Q9C0F1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms