Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CIPCQ9C0C6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIPCQ9C0C6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CIPCQ9C0C6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CIPCQ9C0C6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms