Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TM6SF1Q9BZW5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TM6SF1Q9BZW5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TM6SF1Q9BZW5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TM6SF1Q9BZW5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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