Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM8Q9BZR9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms