Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPEB1Q9BZB8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CPEB1Q9BZB8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPEB1Q9BZB8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.9 ms