Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP1-5Q9BYS1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP1-5Q9BYS1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 376.1 ms