Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TDRD1Q9BXT4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms