Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BRIP1Q9BX63 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BRIP1Q9BX63 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
BRIP1Q9BX63 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BRIP1Q9BX63 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms