Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWS9

CHID1, Chitinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1Q9BWS9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHID1Q9BWS9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHID1Q9BWS9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHID1Q9BWS9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms