Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FNDC11Q9BVV2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FNDC11Q9BVV2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FNDC11Q9BVV2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms