Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KIFC3Q9BVG8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIFC3Q9BVG8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIFC3Q9BVG8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms