Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM62Q9BVG3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM62Q9BVG3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms