Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM109Q9BVC6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM109Q9BVC6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM109Q9BVC6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms