Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC3

DSCC1, Sister chromatid cohesion protein DCC1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCC1Q9BVC3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DSCC1Q9BVC3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DSCC1Q9BVC3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DSCC1Q9BVC3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms