Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC61Q9BV99 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC61Q9BV99 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC61Q9BV99 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms