Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV73

CEP250, Centrosome-associated protein CEP250, humanhuman

Predictions only

Length 2,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP250Q9BV73 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP250Q9BV73 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP250Q9BV73 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms