Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TUBGCP2Q9BSJ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TUBGCP2Q9BSJ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms