Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF559Q9BR84 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF559Q9BR84 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF559Q9BR84 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms