Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BPIFA3Q9BQP9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BPIFA3Q9BQP9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BPIFA3Q9BQP9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms