Protein–RNA interactions for Protein: Q99828

CIB1, Calcium and integrin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB1Q99828 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIB1Q99828 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB1Q99828 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB1Q99828 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB1Q99828 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB1Q99828 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB1Q99828 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB1Q99828 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIB1Q99828 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB1Q99828 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB1Q99828 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB1Q99828 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB1Q99828 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB1Q99828 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB1Q99828 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIB1Q99828 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms