Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSG101Q99816 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSG101Q99816 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSG101Q99816 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSG101Q99816 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSG101Q99816 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSG101Q99816 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSG101Q99816 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSG101Q99816 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSG101Q99816 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSG101Q99816 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSG101Q99816 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TSG101Q99816 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSG101Q99816 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSG101Q99816 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSG101Q99816 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSG101Q99816 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms