Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBBP8Q99708 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP8Q99708 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms