Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LYSTQ99698 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LYSTQ99698 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms