Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIT2Q99578 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIT2Q99578 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIT2Q99578 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIT2Q99578 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIT2Q99578 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RIT2Q99578 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIT2Q99578 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIT2Q99578 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIT2Q99578 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 310.9 ms