Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PHOX2BQ99453 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHOX2BQ99453 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHOX2BQ99453 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHOX2BQ99453 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms