Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CRBNQ96SW2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CRBNQ96SW2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CRBNQ96SW2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms