Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSSK3Q96PN8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSSK3Q96PN8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms