Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPALINQ96PE5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPALINQ96PE5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms