Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RDH12Q96NR8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
RDH12Q96NR8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RDH12Q96NR8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms