Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RILPQ96NA2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RILPQ96NA2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RILPQ96NA2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms