Protein–RNA interactions for Protein: Q96N21

TEPSIN, AP-4 complex accessory subunit Tepsin, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEPSINQ96N21 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TEPSINQ96N21 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TEPSINQ96N21 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TEPSINQ96N21 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms