Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CFAP57Q96MR6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP57Q96MR6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP57Q96MR6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms