Protein–RNA interactions for Protein: Q96M02

C10orf90, Centrosomal protein C10orf90, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf90Q96M02 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C10orf90Q96M02 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf90Q96M02 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf90Q96M02 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf90Q96M02 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf90Q96M02 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf90Q96M02 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C10orf90Q96M02 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf90Q96M02 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf90Q96M02 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf90Q96M02 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf90Q96M02 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C10orf90Q96M02 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C10orf90Q96M02 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C10orf90Q96M02 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms