Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C9orf72Q96LT7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C9orf72Q96LT7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C9orf72Q96LT7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms