Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCPIP1Q96JH7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VCPIP1Q96JH7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VCPIP1Q96JH7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCPIP1Q96JH7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms