Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITCHQ96J02 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITCHQ96J02 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITCHQ96J02 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms