Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
OTUB2Q96DC9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTUB2Q96DC9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTUB2Q96DC9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms