Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC38A4Q969I6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC38A4Q969I6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A4Q969I6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms