Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BHMTQ93088 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BHMTQ93088 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BHMTQ93088 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms