Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP13Q92995 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP13Q92995 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP13Q92995 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP13Q92995 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP13Q92995 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP13Q92995 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP13Q92995 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP13Q92995 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP13Q92995 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP13Q92995 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP13Q92995 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP13Q92995 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP13Q92995 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP13Q92995 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP13Q92995 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP13Q92995 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP13Q92995 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP13Q92995 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP13Q92995 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP13Q92995 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP13Q92995 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP13Q92995 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP13Q92995 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP13Q92995 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP13Q92995 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP13Q92995 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP13Q92995 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP13Q92995 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP13Q92995 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP13Q92995 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP13Q92995 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP13Q92995 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP13Q92995 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP13Q92995 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP13Q92995 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP13Q92995 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP13Q92995 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP13Q92995 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP13Q92995 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP13Q92995 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP13Q92995 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP13Q92995 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP13Q92995 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP13Q92995 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP13Q92995 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP13Q92995 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP13Q92995 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP13Q92995 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP13Q92995 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP13Q92995 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP13Q92995 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP13Q92995 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP13Q92995 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP13Q92995 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP13Q92995 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP13Q92995 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP13Q92995 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP13Q92995 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP13Q92995 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP13Q92995 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP13Q92995 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP13Q92995 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP13Q92995 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP13Q92995 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP13Q92995 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP13Q92995 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP13Q92995 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP13Q92995 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP13Q92995 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP13Q92995 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP13Q92995 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP13Q92995 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP13Q92995 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP13Q92995 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP13Q92995 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP13Q92995 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP13Q92995 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP13Q92995 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP13Q92995 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP13Q92995 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP13Q92995 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP13Q92995 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP13Q92995 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP13Q92995 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP13Q92995 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP13Q92995 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP13Q92995 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP13Q92995 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP13Q92995 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP13Q92995 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP13Q92995 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP13Q92995 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP13Q92995 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP13Q92995 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP13Q92995 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP13Q92995 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP13Q92995 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP13Q92995 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP13Q92995 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms