Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PEX13Q92968 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX13Q92968 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX13Q92968 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms