Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDAQ92838 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDAQ92838 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDAQ92838 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDAQ92838 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDAQ92838 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDAQ92838 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDAQ92838 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDAQ92838 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDAQ92838 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDAQ92838 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDAQ92838 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDAQ92838 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDAQ92838 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDAQ92838 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDAQ92838 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDAQ92838 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDAQ92838 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDAQ92838 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDAQ92838 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDAQ92838 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EDAQ92838 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDAQ92838 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDAQ92838 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDAQ92838 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDAQ92838 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDAQ92838 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDAQ92838 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDAQ92838 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDAQ92838 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDAQ92838 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EDAQ92838 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EDAQ92838 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDAQ92838 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDAQ92838 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDAQ92838 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDAQ92838 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDAQ92838 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDAQ92838 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDAQ92838 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EDAQ92838 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EDAQ92838 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDAQ92838 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDAQ92838 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDAQ92838 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDAQ92838 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDAQ92838 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDAQ92838 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDAQ92838 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDAQ92838 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDAQ92838 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDAQ92838 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDAQ92838 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDAQ92838 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDAQ92838 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDAQ92838 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDAQ92838 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
EDAQ92838 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDAQ92838 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDAQ92838 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDAQ92838 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDAQ92838 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDAQ92838 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDAQ92838 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDAQ92838 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDAQ92838 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDAQ92838 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDAQ92838 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDAQ92838 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDAQ92838 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDAQ92838 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDAQ92838 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDAQ92838 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EDAQ92838 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDAQ92838 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDAQ92838 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDAQ92838 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDAQ92838 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDAQ92838 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDAQ92838 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDAQ92838 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EDAQ92838 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EDAQ92838 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDAQ92838 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDAQ92838 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDAQ92838 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDAQ92838 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EDAQ92838 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDAQ92838 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDAQ92838 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDAQ92838 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDAQ92838 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDAQ92838 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDAQ92838 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EDAQ92838 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDAQ92838 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EDAQ92838 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDAQ92838 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDAQ92838 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDAQ92838 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.3 ms