Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EDEM1Q92611 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EDEM1Q92611 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDEM1Q92611 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDEM1Q92611 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDEM1Q92611 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms