Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
GATAD2BQ8WXI9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GATAD2BQ8WXI9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATAD2BQ8WXI9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms