Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

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Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CNKSR2Q8WXI2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNKSR2Q8WXI2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNKSR2Q8WXI2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNKSR2Q8WXI2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNKSR2Q8WXI2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNKSR2Q8WXI2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNKSR2Q8WXI2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNKSR2Q8WXI2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNKSR2Q8WXI2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNKSR2Q8WXI2 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNKSR2Q8WXI2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CNKSR2Q8WXI2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNKSR2Q8WXI2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNKSR2Q8WXI2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNKSR2Q8WXI2 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CNKSR2Q8WXI2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNKSR2Q8WXI2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNKSR2Q8WXI2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR2Q8WXI2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28■■■□□ 2.07
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