Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYDC1Q8WXC3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PYDC1Q8WXC3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PYDC1Q8WXC3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms