Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C15orf40Q8WUR7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C15orf40Q8WUR7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C15orf40Q8WUR7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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