Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R17PQ8TDU5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R17PQ8TDU5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R17PQ8TDU5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R17PQ8TDU5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R17PQ8TDU5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VN1R17PQ8TDU5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VN1R17PQ8TDU5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms