Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HELQQ8TDG4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HELQQ8TDG4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HELQQ8TDG4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239 ms