Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF398Q8TD17 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF398Q8TD17 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF398Q8TD17 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms